殺菌鍋在一定程度的運行之后會在鍋內部，特別是使用熱水循環進行殺菌的設備會產生一定程度的水垢或者是生銹，這些雜質與水質以及使用頻率有著較大的關系，會嚴重的影響到殺菌的效果，導致殺菌的不完整完整。一般來說是沒三個月進行清洗一次，但如夠水質較硬或者是每日使用超過八個小時則需要每月進行清洗一次。

   水垢為堿物質，一般使用酸對其進行清洗，但需要注意的是不能夠使用鹽酸進行清除?，F如今的殺菌鍋行業都采用的是緩蝕性緩沖液除垢劑，這是使用多種化學配制的，對于金屬的腐蝕性比較得低，除垢的小狗也比較的不錯。

   殺菌鍋的清洗方法：需要對殺菌鍋內部容易結垢的部件，如汽水混合器、蒸汽以及冷卻水的管道、過濾器還有過濾網等結垢性比較強的部件先進行拆除，并進行清洗，這樣能夠有利于清洗后立即觀察有無清洗干凈。

   如果鍋體內部含油污較多，則需要先使用氫氧化鈉溶液或是草酸溶液在內部進行循環，然后在使用水進行循環。洗滌液的濃度應該與油污或者是水垢的程度有著一定的關系。